Le LNCQM est membre depuis 2012 dans le Réseau franco-africain des Laboratoires nationaux de Contrôle de Qualité -LNCQ.
En 2017, il est devenue membre dans le réseau des Laboratoires Officiels de Contrôle des Médicaments en Afrique NOMCol Africa ainsi au système d'évaluation de l'assurance qualité externe (EQAAS) organisé par l'OMS.
